个人简历
郑世茂
郑世茂/男/1992.03
家乡:河北衡水
我的主页
Blog: https://zhengshimao.netlify.app/
Github: https://github.com/zhengshimao
知乎: https://www.zhihu.com/people/deng-tu-lang-zi-l
教育经历
学校 | 专业 | 日期 | 学位 |
---|---|---|---|
太原科技大学 | 生物工程 | 2011.09 - 2015.06 | 学士 |
陕西理工大学 | 生物化学与分子生物学 | 2020.09 - 2023.06 | 硕士 |
生信技能
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能根据
软件使用说明
和R包帮助文档
对软件或R包实现快速使用。一般我还会选择阅读下软件或者R包发表时的文章。 -
项目经验:毕业论文中的数据分析流程均由自己搭建和分析,包括Dual RNA-seq、lncRNA、WGCNA、基因家族(linux/R语言分析并可视化)
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编程:R > linux > perl > python
脚本:https://github.com/zhengshimao/scripts
R包:https://github.com/zhengshimao/BioUncle
R: 完成数据分析变换和画图(tidyverse系列),封装脚本和R包。
Linux: 常用命令、conda或者源码编译部署软件,写一些简单shell脚本
Perl: 封装转换文件格式的脚本;单命令行
Python: 能大致看懂代码,在学习中。
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能熟练地完成转录组相关的基础分析
熟悉软件:hisat2, bowtie2, stringtie, featureCounts, htseq-count, kallisto, rsem, salmon, CPC2, PLEK, RNAplonc, lncFinder, DESeq2, limma, edgeR, clusterProfiler, enrichplot, circlize,ggtree, gggenes,ggplot2, dplyr, stringr等
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了解其它分析
帮助课题组完成过GWAS部分分析:plink, Tassel, LDheatmap;
基因组相关:MCScanX, JCVI, Repeatmodeler, RepeatMask;
系统发育相关:Musscle, mafft, iqtree2, ggtree
GEO数据挖掘:做过基础分析流程;
单细胞测序:做过基础分析流程.
工作经历
北京东方红航天生物技术股份有限公司
发酵主管 2015年09月 - 2020年04月
- 负责固体发酵工艺优化;
- 负责菌株传代与保藏;
- 负责空间诱变育种的菌种制备与筛选。
自我评价
学习能力强,有责任心,乐于助人,注重科研工作中的细节,能处理好人际关系。