个人简历

郑世茂

郑世茂/男/1992.03

家乡:河北衡水

Email: zhengshimao007@163.com

我的主页

Blog: https://zhengshimao.netlify.app/

Github: https://github.com/zhengshimao

R包 BioUncle

个人公开脚本

知乎: https://www.zhihu.com/people/deng-tu-lang-zi-l

教育经历

学校 专业 日期 学位
太原科技大学 生物工程 2011.09 - 2015.06 学士
陕西理工大学 生物化学与分子生物学 2020.09 - 2023.06 硕士

生信技能

  • 能根据软件使用说明R包帮助文档对软件或R包实现快速使用。一般我还会选择阅读下软件或者R包发表时的文章。

  • 项目经验:毕业论文中的数据分析流程均由自己搭建和分析,包括Dual RNA-seq、lncRNA、WGCNA、基因家族(linux/R语言分析并可视化)

  • 编程:R > linux > perl > python

    脚本:https://github.com/zhengshimao/scripts

    R包:https://github.com/zhengshimao/BioUncle

    R: 完成数据分析变换和画图(tidyverse系列),封装脚本和R包。

    Linux: 常用命令、conda或者源码编译部署软件,写一些简单shell脚本

    Perl: 封装转换文件格式的脚本;单命令行

    Python: 能大致看懂代码,在学习中。

  • 能熟练地完成转录组相关的基础分析

    熟悉软件:hisat2, bowtie2, stringtie, featureCounts, htseq-count, kallisto, rsem, salmon, CPC2, PLEK, RNAplonc, lncFinder, DESeq2, limma, edgeR, clusterProfiler, enrichplot, circlize,ggtree, gggenes,ggplot2, dplyr, stringr等

  • 了解其它分析

    帮助课题组完成过GWAS部分分析:plink, Tassel, LDheatmap;

    基因组相关:MCScanX, JCVI, Repeatmodeler, RepeatMask;

    系统发育相关:Musscle, mafft, iqtree2, ggtree

    GEO数据挖掘:做过基础分析流程;

    单细胞测序:做过基础分析流程.

工作经历

北京东方红航天生物技术股份有限公司

发酵主管 2015年09月 - 2020年04月

  • 负责固体发酵工艺优化;
  • 负责菌株传代与保藏;
  • 负责空间诱变育种的菌种制备与筛选。

自我评价

学习能力强,有责任心,乐于助人,注重科研工作中的细节,能处理好人际关系。


请我喝杯咖啡吧 ヾ(^▽^*)))
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